中新網(wǎng)記者30日從天津國際生物醫(yī)藥聯(lián)合研究院獲悉，該院與南開大學(xué)藥學(xué)院團(tuán)隊(duì)近日發(fā)現(xiàn)可預(yù)防冠狀病毒感染作用的候選分子。
自新型冠狀病毒疫情爆發(fā)以來，天津國際生物醫(yī)藥聯(lián)合研究院高度關(guān)注疫情動(dòng)態(tài)，與南開大學(xué)藥學(xué)院組建新藥開發(fā)聯(lián)合攻關(guān)團(tuán)隊(duì)，針對(duì)新型冠狀病毒的生物學(xué)特點(diǎn)、傳播特征和公共衛(wèi)生風(fēng)險(xiǎn)防控的潛在需求，開展了病毒防治相關(guān)藥物的研發(fā)工作，重點(diǎn)從藥食同源分子中篩選預(yù)防冠狀病毒感染作用的有效分子，取得了階段性進(jìn)展。
新型冠狀病毒的基因序列公開后，已有多個(gè)研究團(tuán)隊(duì)針對(duì)病毒內(nèi)部的蛋白酶進(jìn)行了藥物開發(fā)，同時(shí)也報(bào)道了該病毒的主要受體為人肺泡上皮細(xì)胞的ACE2蛋白。
“我們的研究對(duì)于廣大人群預(yù)防病毒感染具有更重要的意義。”天津國際生物醫(yī)藥聯(lián)合研究院科研部一位研究員電話接受中新網(wǎng)記者采訪時(shí)介紹，從病毒侵染人肺泡上皮的過程來看，其首先利用自身的Spike蛋白與ACE2蛋白發(fā)生相互作用，從而侵入人體。開發(fā)針對(duì)Spike與ACE2蛋白相互作用的界面抑制劑，可有效地切斷兩個(gè)蛋白的結(jié)合，進(jìn)而阻斷病毒侵入人體細(xì)胞，達(dá)到預(yù)防感染的作用。
針對(duì)病毒Spike蛋白/ACE2互作界面抑制劑的研發(fā)，尤其是從藥食同源分子中篩選有效分子，對(duì)預(yù)防病毒感染具有更重要的意義。
天津國際生物醫(yī)藥聯(lián)合研究院與南開大學(xué)藥學(xué)院聯(lián)合攻關(guān)團(tuán)隊(duì)擬通過人工智能篩選、活性驗(yàn)證和成藥性評(píng)價(jià)的三步走方式進(jìn)行預(yù)防性藥物的研發(fā)，通過同源建模搭建了新型冠狀病毒Spike蛋白/人ACE2蛋白互作的三維結(jié)構(gòu)，利用人工智能輔助的虛擬藥物篩選系統(tǒng)，從中藥單體庫、藥食同源天然分子庫和成藥化合物庫中篩選潛在的互作界面抑制劑，尤其關(guān)注藥食同源類物質(zhì)所含的活性分子。
“我們從公布的2019_nCov蛋白序列中提取了蛋白序列，根據(jù)SARS病毒Spike蛋白/人ACE2蛋白識(shí)別的模式，采用同源建模的方法模擬了Spike蛋白的CTD1區(qū)域和人ACE2蛋白復(fù)合物結(jié)構(gòu)。通過比對(duì)SARS病毒Spike蛋白/人ACE2蛋白的結(jié)合模式，明確了2019_nCov病毒CTD1/人ACE2復(fù)合物的蛋白-蛋白相互作用界面的熱點(diǎn)和關(guān)鍵殘基，利用基于結(jié)構(gòu)的藥效團(tuán)方法，以ACE2氨基酸殘基構(gòu)建藥效團(tuán)模型，靶向CTD1區(qū)域與ACE2結(jié)合的表面，篩選候選抑制劑，阻斷病毒與人體ACE2蛋白的識(shí)別與結(jié)合。”科研團(tuán)隊(duì)成員說。
最終通過構(gòu)建的藥效團(tuán)模型并結(jié)合分子對(duì)接篩選方法，從成藥化合物庫(2373個(gè)化合物)和藥食同源數(shù)據(jù)庫(5632個(gè)化合物)篩選得到靶向S蛋白的潛在抑制劑。通過篩選和既往藥理信息的綜合分析，觀察到多種藥食同源的中藥中含有抑制病毒與受體結(jié)合的潛在活性分子，可為中醫(yī)藥方劑的配伍和新型冠狀病毒肺炎的防治提供了一定的信息。
這位研究員告訴中新網(wǎng)記者，根據(jù)研究成果和藥食同源的原理，民眾多吃生姜、多喝金銀花茶之類的食物、飲品，應(yīng)該可以增強(qiáng)預(yù)防病毒感染的體質(zhì)。
自新型冠狀病毒疫情爆發(fā)以來，天津國際生物醫(yī)藥聯(lián)合研究院高度關(guān)注疫情動(dòng)態(tài)，與南開大學(xué)藥學(xué)院組建新藥開發(fā)聯(lián)合攻關(guān)團(tuán)隊(duì)，針對(duì)新型冠狀病毒的生物學(xué)特點(diǎn)、傳播特征和公共衛(wèi)生風(fēng)險(xiǎn)防控的潛在需求，開展了病毒防治相關(guān)藥物的研發(fā)工作，重點(diǎn)從藥食同源分子中篩選預(yù)防冠狀病毒感染作用的有效分子，取得了階段性進(jìn)展。
新型冠狀病毒的基因序列公開后，已有多個(gè)研究團(tuán)隊(duì)針對(duì)病毒內(nèi)部的蛋白酶進(jìn)行了藥物開發(fā)，同時(shí)也報(bào)道了該病毒的主要受體為人肺泡上皮細(xì)胞的ACE2蛋白。
“我們的研究對(duì)于廣大人群預(yù)防病毒感染具有更重要的意義。”天津國際生物醫(yī)藥聯(lián)合研究院科研部一位研究員電話接受中新網(wǎng)記者采訪時(shí)介紹，從病毒侵染人肺泡上皮的過程來看，其首先利用自身的Spike蛋白與ACE2蛋白發(fā)生相互作用，從而侵入人體。開發(fā)針對(duì)Spike與ACE2蛋白相互作用的界面抑制劑，可有效地切斷兩個(gè)蛋白的結(jié)合，進(jìn)而阻斷病毒侵入人體細(xì)胞，達(dá)到預(yù)防感染的作用。
針對(duì)病毒Spike蛋白/ACE2互作界面抑制劑的研發(fā)，尤其是從藥食同源分子中篩選有效分子，對(duì)預(yù)防病毒感染具有更重要的意義。
天津國際生物醫(yī)藥聯(lián)合研究院與南開大學(xué)藥學(xué)院聯(lián)合攻關(guān)團(tuán)隊(duì)擬通過人工智能篩選、活性驗(yàn)證和成藥性評(píng)價(jià)的三步走方式進(jìn)行預(yù)防性藥物的研發(fā)，通過同源建模搭建了新型冠狀病毒Spike蛋白/人ACE2蛋白互作的三維結(jié)構(gòu)，利用人工智能輔助的虛擬藥物篩選系統(tǒng)，從中藥單體庫、藥食同源天然分子庫和成藥化合物庫中篩選潛在的互作界面抑制劑，尤其關(guān)注藥食同源類物質(zhì)所含的活性分子。
“我們從公布的2019_nCov蛋白序列中提取了蛋白序列，根據(jù)SARS病毒Spike蛋白/人ACE2蛋白識(shí)別的模式，采用同源建模的方法模擬了Spike蛋白的CTD1區(qū)域和人ACE2蛋白復(fù)合物結(jié)構(gòu)。通過比對(duì)SARS病毒Spike蛋白/人ACE2蛋白的結(jié)合模式，明確了2019_nCov病毒CTD1/人ACE2復(fù)合物的蛋白-蛋白相互作用界面的熱點(diǎn)和關(guān)鍵殘基，利用基于結(jié)構(gòu)的藥效團(tuán)方法，以ACE2氨基酸殘基構(gòu)建藥效團(tuán)模型，靶向CTD1區(qū)域與ACE2結(jié)合的表面，篩選候選抑制劑，阻斷病毒與人體ACE2蛋白的識(shí)別與結(jié)合。”科研團(tuán)隊(duì)成員說。
最終通過構(gòu)建的藥效團(tuán)模型并結(jié)合分子對(duì)接篩選方法，從成藥化合物庫(2373個(gè)化合物)和藥食同源數(shù)據(jù)庫(5632個(gè)化合物)篩選得到靶向S蛋白的潛在抑制劑。通過篩選和既往藥理信息的綜合分析，觀察到多種藥食同源的中藥中含有抑制病毒與受體結(jié)合的潛在活性分子，可為中醫(yī)藥方劑的配伍和新型冠狀病毒肺炎的防治提供了一定的信息。
這位研究員告訴中新網(wǎng)記者，根據(jù)研究成果和藥食同源的原理，民眾多吃生姜、多喝金銀花茶之類的食物、飲品，應(yīng)該可以增強(qiáng)預(yù)防病毒感染的體質(zhì)。
